Los territorios indígenas se distribuyen en todo el territorio nacional:
En el Centro, Sur y Este, se encuentran los Pueblos Lenca (Intibuca, Lempira, La Paz, Santa Bárbara, Comayagua Francisco Morazán y valle), Pech (Olancho, Colon y Gracias a Dios).
En la Costa Atlántica se encuentran los Negros de Habla Inglesa y Garífunas (Cortes, Atlántida, Colon, Gracias a Dios e Islas de la Bahía), los Miskitos (Gracias a Dios), los Nahuas (Olancho), Tawahkas (Gracias a Dios y Olancho).
En la zona de frontera con Guatemala los Chorti (Copan y Ocotepeque), y los Tolupanes en Yoro y el Norte de Francisco Morazán.
En los 90, el Estado otorgó títulos de tierra por 3.200 has a favor de las comunidades Garífunas de los Departamentos de Cortés, Atlántida, Islas de la Bahía, Colón y Gracias a Dios.
